Если ты в центре Петах-Тиквы или ближе к Тель-Авиву (около больницы Бейлинсон, например) - рекомендую маршруткой #51 до севера Тель-Авива (т.е. автобусного терминала Арлозоров, рядом со станцией поезда "Тель-Авив - мерказ (Савидор)" (которую в народе называют "Ракевет-Цафон")), а оттуда автобусом 480 (он выходит каждые 15 минут и сразу съезжает на Аялон, т.е. ты не застреваешь в центре Тель-Авива; автобус едет до Иерусалима около часа). Маршруткой можно ехать до Алмазной Биржи (бурса) и пройти к автобусной станции через железнодорожную - по такой трубе над шоссе Нетивей-Аялон, взяв в автомате бесплатный билетозаменитель который называется как-то вроде "картис маавар гешер бурса" - этим выигрывается несколько шекелей, т.к. биржа ещё в Рамат-Гане, а остановка, на которой водитель маршрутки остановится, если сказать ему "ракевет-цафон" - уже в Тель-Авиве.

Если же ты в восточной части Петах-Тиквы, можно ехать прямо в Иерусалим автобусом 947 с цомет Ганим или Сиркин. Он в середине дня в среднем раз в полчаса, но точно знать время не получится, т.к. он едет из Хайфы. В Иерусалим едет около полутора часов, через аэропорт.